TOICAで電車へ乗車する場合は、自動改札機の乗車券投入口の上にあるTOICA読み取り部にカードをタッチします。
TOICAをタッチすると、信号音（ピッという音）が鳴り、自動改札機の扉が開くので通過します。

※但し、一部の駅には扉のない簡易型自動改札機が設置されています。
無人駅にもTOICA専用の自動改札機（簡易TOICA改札機）が設置されていて、同様にタッチすることで扉のある自動改札機と同じように通過できます。

運賃は乗車時に初乗り運賃を前引きするのではなく、降車駅で乗車した区間の運賃が一括して精算されるようになっています。
なおTOICAの残額が0円でも駅へは入場できます。
（Suicaエリアでは入場駅が属する事業者の初乗り運賃に満たない場合、ICOCAエリアでは残額が0円の場合は入場できない）。

※扉のない改札機でタッチせずに入・出場すると、入退場記録が行われていないため、次回から利用できなくなる場合があるので注意が必要です。